En el departamento de biología marina se estudian una amplia variedad de aspectos de los organismos de altas latitudes, entre los que se destacan, biología reproductiva, fisiología, biología pesquera, contaminación marina, cambio climático y ecología molecular.
Las líneas de investigación que desarrollan los grupos de trabajo se enmarcan dentro de la Iniciativa Pampa Azul, un plan estratégico dirigido a promover el conocimiento científico, el desarrollo tecnológico y la innovación productiva en el Atlántico Sur, aportando por este medio a la soberanía y al desarrollo social, económico y ambientalmente sostenible.